企業(yè)跨地區(qū)經(jīng)營現(xiàn)象比較普遍，按照業(yè)務(wù)發(fā)展的需要，一般跨地區(qū)經(jīng)營企業(yè)早期實(shí)行人員外派，然后設(shè)立辦事處，再是設(shè)立分公司，最后考慮設(shè)立子公司。
　　以上幾種跨地區(qū)經(jīng)營形式在企業(yè)所得稅的處理上有很大的不同。在實(shí)行人員外派和設(shè)立辦事處的情況下，外地人員所發(fā)生的費(fèi)用都?xì)w入公司總部，一般在外地不存在企業(yè)所得稅納稅義務(wù)的發(fā)生，所以在早期的市場(chǎng)拓展階段，外地業(yè)務(wù)還沒有形成穩(wěn)定的收入流，這種情況下采取人員外派和設(shè)立辦事處最有利;如果外地業(yè)務(wù)已經(jīng)形成穩(wěn)定的收入流，且收入減去成本費(fèi)用后有盈利，那么就可以考慮設(shè)立子公司，子公司和公司總部一樣是獨(dú)立的企業(yè)所得稅納稅人。本文重點(diǎn)討論在外地設(shè)立分公司的情形。
　　《企業(yè)所得稅法》第五十條規(guī)定，居民企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機(jī)構(gòu)的，應(yīng)當(dāng)匯總計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅。這就決定了分公司的企業(yè)所得稅應(yīng)當(dāng)由總公司匯總計(jì)算。
　　同時(shí)，按照國家稅務(wù)總局公告2012年第57號(hào)《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》(以下簡(jiǎn)稱“57號(hào)公告”)規(guī)定的“統(tǒng)一計(jì)算、分級(jí)管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財(cái)政調(diào)庫”原則，總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)需要按照規(guī)定的比例計(jì)算出應(yīng)納企業(yè)所得稅額后就地預(yù)繳，年終由總機(jī)構(gòu)匯總計(jì)算應(yīng)繳應(yīng)退稅額，再按照規(guī)定比例在總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)間分?jǐn)倯?yīng)繳應(yīng)退稅額，由總機(jī)構(gòu)和各分支機(jī)構(gòu)分別就地辦理退補(bǔ)稅款。在總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)所處地區(qū)企業(yè)所得稅稅率不同的情況下，這種計(jì)算方法就給了納稅人一定的籌劃空間。
　　當(dāng)然，現(xiàn)行企業(yè)所得稅法已經(jīng)取消了大部分的地區(qū)性稅率優(yōu)惠，過渡期稅率優(yōu)惠于2012年底到期終止，目前僅剩下西部大開發(fā)稅率優(yōu)惠，因此，跨地區(qū)經(jīng)營的企業(yè)總部設(shè)立地點(diǎn)選擇，以及在總部和各二級(jí)分支機(jī)構(gòu)之間合理分配資產(chǎn)、人員、營業(yè)收入，以充分享受西部大開發(fā)稅收優(yōu)惠政策，具有一定的納稅籌劃空間。
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