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得依據(jù)發(fā)票稅前扣除。
另外，根據(jù)營業(yè)稅暫行條例實施細(xì)則
條例第六條所稱符合國務(wù)院稅務(wù)主管部門有關(guān)規(guī)定的憑證（以下統(tǒng)稱合 法有效憑證），是指：
（一）支付給境內(nèi)單位或者個人的款項，且該單位或者個人發(fā)生的行為屬于營業(yè)稅或者增值稅征收范圍的，以該單位或者個人開具的發(fā)票為合法有效憑證；
?。ǘ┲Ц兜男姓聵I(yè)性收費或者政府性基金，以開具的財政票據(jù)為合法有效憑證；
?。ㄈ┲Ц督o境外單位或者個人的款項，以該單位或者個人的簽收單據(jù)為合法有效憑證，稅務(wù)機關(guān)對簽收單據(jù)有疑義的，可以要求其提供境外公證機構(gòu)的確認(rèn)證明；
（四）國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他合法有效憑證。
因此，要判定收款方取得收入是否應(yīng)納流轉(zhuǎn)稅，來決定支出是否應(yīng)取得發(fā)票：
（1）收款方取得收入應(yīng)繳流轉(zhuǎn)稅，一定要取得發(fā)票，作為合法、有效憑證
（2）收款方取得收入不納或法定減免免流轉(zhuǎn)稅，應(yīng)憑收據(jù)和合同或協(xié)議等法律文件，作為合法有效憑證
對于拆遷補償費，房地產(chǎn)企業(yè)出具下列憑證可以稅前扣除：
A．政府規(guī)定的拆遷補償費標(biāo)準(zhǔn)的文件
B．被拆遷人簽字的收款收據(jù)或收條
C．被拆遷戶的門牌號碼
D．被拆遷人與房地產(chǎn)企業(yè)簽訂的拆遷補償費協(xié)議
另外，取得的青苗補償費不征營業(yè)稅也就不需要發(fā)票。
根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于土地使用者將土地使用權(quán)歸還給土地所有者行為營業(yè)稅問題的通知》（國稅函[2008]277號）文件規(guī)定，納稅人將土地使用權(quán)歸還給土地所有者時，只要出具縣級（含）以上地方人民政府收回土地使用權(quán)的正式文件，無論支付征地補償費的資金來源是否為政府財政資金，該行為均屬于土地使用者將土地使用權(quán)歸還給土地所有者的行為，按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈營業(yè)稅稅目注釋（試行稿）〉的通知》（國稅發(fā)[1993]149號）規(guī)定，不征收營業(yè)稅。
根據(jù)上述規(guī)定，只要出具縣級（含）以上地方人民政府收回土地使用權(quán)的正式文件，青苗補償費不屬于按照國稅函發(fā)[1997]87號文件規(guī)定應(yīng)該征收營業(yè)稅的情形，而按照國稅函[2008]277號文件規(guī)定屬于不征收營業(yè)稅的情形，因此，對土地承包人取得的青苗補償費收入不征營業(yè)稅，不征營業(yè)稅也就不需要發(fā)票。
2、產(chǎn)權(quán)調(diào)換形式。拆遷人以易地建設(shè)或原地建設(shè)的房屋補償給被拆除房屋的所有人，使原所有人繼續(xù)保持其對房屋的所有權(quán)，這就是我們通常所說的“拆一還一” 實物補償形式 。
如果被拆遷戶選擇就地安置房屋補償方式，需要從兩個方面考慮，
一方面按照31號文件規(guī)定確認(rèn)視同銷售所得，對補償?shù)姆课莅凑展蕛r值或參照同期同類房屋的市場價格確定視同銷售收入，同時按照稅收規(guī)定計算確認(rèn)拆遷安置房屋的視同銷售成本。
另一方面，需要確認(rèn)土地成本中的“拆遷補償費支出”。因為房屋補償方式相當(dāng)于房地產(chǎn)企業(yè)向被拆遷戶支付貨幣補償資金，然后被拆遷戶再用這筆貨幣補償資金向房地產(chǎn)企業(yè)購入房屋，因此應(yīng)按公允價值或同期同類房屋市場價格計算的金額作為“拆遷補償費”計入開發(fā)成本的土地成本中。
也就是說：
回遷房和其他的商品房一樣，成本也分為兩個方面
1、建筑成本等
2、以房換地按房屋公允價值計算的土地成本，注意這里以房換地要按公允價值計算。
會計的規(guī)定：
以非貨幣性形式支付的拆遷補償支出、安置及動遷支出、回遷房建造支出，適用上述《企業(yè)會計準(zhǔn)則第7號-非貨幣資產(chǎn)交換》的規(guī)定，回遷房的非貨幣性資產(chǎn)交換，預(yù)計未來能帶來更多現(xiàn)金流，一般情況下是具有商業(yè)實質(zhì)，且公允價值能夠可靠計量。企業(yè)所得稅方面可以該資產(chǎn)的公允價值為計稅基礎(chǔ)。
所得稅實施條例第66條（3)的規(guī)定：
通過捐贈、投資、非貨幣性資產(chǎn)交換、債務(wù)重組等方式取得的無形資產(chǎn)，以該資產(chǎn)的公允價值和支付的相關(guān)稅費為計稅基礎(chǔ) 。
例：某房地產(chǎn)企業(yè)就地安置拆遷戶5000平米，市場售價8000元，土地成本(土地出讓金)2億元，建筑施工等其他開發(fā)成本1億元，總可售面積8萬平米。
第1：支付建筑施工等其他開發(fā)成本1億元
第2、拆遷補償費支出：5000*8000=4000萬元
（注意：這里的拆遷補償費不是拆遷戶5000平米的，而是整個樓盤的，拆遷補償費支出要按總可售面積計算分?jǐn)偂＃?/div> 
視同銷售收入： 5000*8000=4000萬元
第3、單位可售面積計稅成本=（土地2億+土地4000萬+建筑1億）/80000平米=4250/平米
第4、視同銷售成本=4250*5000=2125萬元，
視同銷售所得=4000-2125=1875萬元
(五)以土地使用權(quán)投資入股方式 取得土地成本的確定
以土地使用權(quán)投資入股，節(jié)省稅負(fù)的有限，只按財稅【2002】191號文件規(guī)定省略了營業(yè)稅，根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)處置資產(chǎn)所得稅處理問題的通知》(國稅函[2008]828號)文件規(guī)定，凡是資產(chǎn)所有權(quán)屬發(fā)生改變的應(yīng)按規(guī)定視同銷售確認(rèn)收入。因此對外投資的土地，對于投資的法人企業(yè)應(yīng)當(dāng)視同銷售，對外投資的土地按照公允價值確認(rèn)視同銷售收入，對其計稅基礎(chǔ)確認(rèn)視同銷售成本，差額調(diào)增應(yīng)納稅所得額；對于接受土地使用權(quán)投資入股法人企業(yè)的好處是投資的溢價可以作為土地成本在企業(yè)所得稅前扣除。
(六)以合作建房方式取得土地成本的確定
合作建房主要有兩種方式
*9種方式：甲方擁有土地，乙方擁有資金及資質(zhì)，合作建房，然后分房子。此種合作建房，必須是聯(lián)合立項，或者乙方立項。
1、在分配產(chǎn)品環(huán)節(jié)確認(rèn)成本（該項土地）
國稅發(fā)【2009】31號 第三十一條 規(guī)定： 企業(yè)以非貨幣交易方式取得土地使用權(quán)的，應(yīng)按下列規(guī)定確定其成本：
企業(yè)、單位以換取開發(fā)產(chǎn)品為目的，將土地使用權(quán)投資企業(yè)的，按下列規(guī)定進行處理：
換取的開發(fā)產(chǎn)品如為該項土地開發(fā)、建造的，接受投資的企業(yè)在接受土地使用權(quán)時暫不確認(rèn)其成本，待首次分出開發(fā)產(chǎn)品時，再按應(yīng)分出開發(fā)產(chǎn)品（包括首次分出的和以后應(yīng)分出的）的市場公允價值和土地使用權(quán)轉(zhuǎn)移過程中應(yīng)支付的相關(guān)稅費計算確認(rèn)該項土地使用權(quán)的成本。如涉及補價，土地使用權(quán)的取得成本還應(yīng)加上應(yīng)支付的補價款或減除應(yīng)收到的補價款。
這里主要是考慮收入與成本的配比
【案例1】A公司與甲房地產(chǎn)公司簽訂協(xié)議，將其名下100畝土地（按評估價每畝100萬元，總價10000萬元轉(zhuǎn)讓）用于與甲房地產(chǎn)公司合作開發(fā)，待項目開發(fā)完畢后，分得該項目30000平方米房屋，房地產(chǎn)公司取得該項土地時支付各項稅費500萬元元，分配開發(fā)產(chǎn)品時，房屋的單位成本價為每平方米3000元，公允價值為每平方米5500元。計算該項土地的成本。
該土地的成本＝5500×30000＋500＝17000萬元
注意 （1）不能按照土地轉(zhuǎn)讓價作為成本；
?。?）不能按照開發(fā)產(chǎn)品的成本價作為成本。
2、在接受土地環(huán)節(jié)確認(rèn)成本（其他土地）
換取的開發(fā)產(chǎn)品如為其他土地開發(fā)、建造的，接受投資的企業(yè)在投資交易發(fā)生時，按應(yīng)付出開發(fā)產(chǎn)品市場公允價值和土地使用權(quán)轉(zhuǎn)移過程中應(yīng)支付的相關(guān)稅費計算確認(rèn)該項土地使用權(quán)的成本。如涉及補價,土地使用權(quán)的取得成本還應(yīng)加上應(yīng)支付的補價款或減除應(yīng)收到的補價款。
這樣規(guī)定主要是考慮換出的開發(fā)產(chǎn)品并非在該土地上建造的，可能會存在換入土地使用權(quán)的同時就交付開發(fā)產(chǎn)品的情況，二者可能是同步的。
【案例2】A公司與甲房地產(chǎn)公司簽訂協(xié)議，用其名下50畝土地（按評估價每畝100萬元，總價5000萬元轉(zhuǎn)讓）換取甲房地產(chǎn)公司名下一處房
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