稅務(wù)稽查包含選案、實(shí)施稽查、審理、執(zhí)行四個(gè)部分。
　　一、選案
　　確定稅務(wù)稽查對(duì)象是稅務(wù)稽查的重要環(huán)節(jié)。目前稽查選案分為：人工選案、計(jì)算機(jī)選案、舉報(bào)、其他等
　　人工選案的基本方法是抽樣。實(shí)施抽樣又分為隨機(jī)抽樣和非隨機(jī)抽樣。在實(shí)行抽查選案時(shí)，一般都采用隨機(jī)抽樣法，它是按照概率規(guī)律抽取稽查對(duì)象的一種方法。
　　計(jì)算機(jī)選案的指標(biāo)主要有以下幾個(gè)方面：分行業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)指標(biāo)平均增長(zhǎng)值分析、分行業(yè)財(cái)務(wù)比率分析、企業(yè)常用財(cái)務(wù)指標(biāo)分析、流轉(zhuǎn)稅類選案分析、企業(yè)所得稅稅前限制列支項(xiàng)目指標(biāo)分析、進(jìn)出口稅收指標(biāo)分析、稅收管理指標(biāo)分析等。
　　舉報(bào)是稅務(wù)機(jī)關(guān)發(fā)現(xiàn)案源最多的一種途徑。
 
　　其他選案方法指：轉(zhuǎn)辦、交辦等。
　　二、實(shí)施稽查
　　稅務(wù)稽查實(shí)施階段是稅務(wù)稽查工作的核心和關(guān)鍵環(huán)節(jié)。稅務(wù)稽查必須依照法律規(guī)定權(quán)限實(shí)施。稅務(wù)稽查人員在實(shí)施稽查之前，除另有規(guī)定之外，應(yīng)當(dāng)提前以書(shū)面形式通知被查對(duì)象，向被查對(duì)象下達(dá)《稅務(wù)稽查通知書(shū)》，并由收件人填寫(xiě)送達(dá)回證。稅務(wù)人員在實(shí)施稅務(wù)稽查時(shí)可以根據(jù)需要和法定程序采取詢問(wèn)、調(diào)取賬簿資料、實(shí)地稽查、賬外調(diào)查和異地協(xié)查等方式進(jìn)行。稅務(wù)稽查人員在稅務(wù)查賬時(shí)，應(yīng)在《稅務(wù)稽查底稿》上逐筆如實(shí)紀(jì)錄稽查中發(fā)現(xiàn)的問(wèn)題及所涉及的賬戶、記賬憑證、金額等細(xì)節(jié)，全面反映此項(xiàng)稽查工作的情況。稅務(wù)稽查實(shí)施終結(jié)，稅務(wù)稽查人員應(yīng)當(dāng)認(rèn)真整理檢查資料，歸集相關(guān)證據(jù)，計(jì)算補(bǔ)退稅款，分析檢查結(jié)果，提出處理意見(jiàn)，并根據(jù)立案查處、未經(jīng)立案查處以及稽查中發(fā)現(xiàn)的問(wèn)題等不同情況，決定實(shí)行一般工作程序或簡(jiǎn)易工作程序，并分別制作《稅務(wù)稽查報(bào)告》、《稅務(wù)處理決定書(shū)》或《稅務(wù)稽查結(jié)論》。
　　三、審理
　　稅務(wù)稽查審理，是稅務(wù)稽查機(jī)構(gòu)對(duì)其立案查處的各類稅務(wù)違法案件在實(shí)施稽查完畢的基礎(chǔ)上，由專門(mén)組織或人員核準(zhǔn)案件實(shí)施、審查鑒別證據(jù)、分析認(rèn)定案件性質(zhì)，制作《審理報(bào)告》和《稅務(wù)處理決定書(shū)》或《稅務(wù)稽查結(jié)論》的活動(dòng)過(guò)程。
　　稅務(wù)稽查審理主要包括：1.違法事實(shí)是否清楚、證據(jù)是否確鑿、數(shù)據(jù)是否準(zhǔn)確、資料是否齊全。2.適用稅收法律、法規(guī)、規(guī)章是否合法。3.是否符合法定程序。4.擬定的處理意見(jiàn)是否得當(dāng)。
　　審理終結(jié)的處理有以下幾種處理方法：1.同意《稅務(wù)稽查報(bào)告》、2.補(bǔ)正《稅務(wù)稽查報(bào)告》、3.不同意《稅務(wù)稽查報(bào)告》、4.構(gòu)成犯罪案件的處理——移送。
　　對(duì)稅收違法行為的處罰應(yīng)根據(jù)及其實(shí)施細(xì)則以及的規(guī)定處理。
　　四、執(zhí)行
　　隨著稅收法制建設(shè)的不斷加強(qiáng)，納稅人的稅收法制觀念也在不斷提高，稅務(wù)稽查文書(shū)送達(dá)后，被查對(duì)象一般都能自動(dòng)履行稅務(wù)機(jī)關(guān)做出的法律文書(shū)所規(guī)定的義務(wù)——自動(dòng)辦理補(bǔ)報(bào)繳納。逾期不履行的，稅務(wù)機(jī)關(guān)將采取強(qiáng)制執(zhí)行措施。
　　稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)稅務(wù)違法行為處理完畢后，應(yīng)制作執(zhí)行報(bào)告并交審理部門(mén)整理存檔。屬于公民舉報(bào)的案件，還應(yīng)依照有關(guān)規(guī)定做好獎(jiǎng)勵(lì)舉報(bào)人的事宜。