會計核算：
1.企業(yè)應按照國家財務會計制度要求，對研發(fā)支出進行會計處理；同時，對享受加計扣除的研發(fā)費用按研發(fā)項目設置輔助賬，準確歸集核算當年可加計扣除的各項研發(fā)費用實際發(fā)生額。企業(yè)在一個納稅年度內進行多項研發(fā)活動的，應按照不同研發(fā)項目分部歸集可加計扣除的研發(fā)費用。
2.企業(yè)應對研發(fā)費用和生產經營費用分別核算，準確、合理歸集各項費用支出，對劃分不清的，不得實行加計扣除。
注意事項：
1.新規(guī)定適用于會計核算健全、實行查賬征收并能夠準確歸集研發(fā)費用的居民企業(yè)。
2.企業(yè)研發(fā)費用各項目的實際發(fā)生額歸集不準確、匯總額計算不準確的，稅務機關有權對其稅前扣除額或加計扣除額進行合理調整。
3.稅務機關對企業(yè)享受加計扣除優(yōu)惠的研發(fā)項目有異議的，可以轉請地市級（含）以上科技行政主管部門出具鑒定意見，科技部門應及時回復意見。企業(yè)承擔省部級（含）以上科研項目的，以及以前年度已鑒定的跨年度研發(fā)項目，不再需要鑒定。
4.企業(yè)符合規(guī)定的研發(fā)費用加計扣除條件而在2016年1月1日以后未及時享受該項稅收優(yōu)惠的，科研追溯享受并履行備案手續(xù)，追溯期限最長為3年。
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