計算機被引入數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)后，會計信息系統(tǒng)呈現(xiàn)出不同于一般手工系統(tǒng)的特征，這既使得審計中有些風險減少，也增加了許多在手工系統(tǒng)中較小的或不曾有的風險，從而使得加強會計信息化系統(tǒng)的內部控制成為實施單位都不可忽視的一項重要工作。
　　會計電算化信息系統(tǒng)需要把住的關口有：
　　差錯的反復發(fā)生
　　計算機系統(tǒng)處理的集中化與高速性，使得其處理結果一旦發(fā)生錯誤，就會在短時間內迅速蔓延，使得多種文件、賬簿，以至整個系統(tǒng)失真。如果發(fā)生錯誤的原因在于系統(tǒng)程序和系統(tǒng)軟件，則計算機就會重復執(zhí)行同一錯誤操作。
　　數(shù)據(jù)安全性差
　　目前，大量的計算機數(shù)據(jù)都集中存儲于磁、光介質中，一旦發(fā)生火災、水災、被盜之類的事件，就可能導致全部數(shù)據(jù)丟失或者毀損；而磁、光介質的保存對環(huán)境的要求較高，不僅要防水、防火，還要防塵、防磁，而且對溫度還有一定的要求，從而增加了數(shù)據(jù)的脆弱性。
　　輸入差錯的嚴重性
　　在信息處理過程中，“垃圾進，垃圾出”，即如果輸入數(shù)據(jù)出 錯，以后的處理環(huán)節(jié)再正確，也只能輸出錯誤的信息。另外，計算機會計信息系統(tǒng)的輸入過程較手工系統(tǒng)多了一道程序，即需將人類可讀的數(shù)據(jù)轉換為機器可讀的代碼形式，這一環(huán)節(jié)無論采用聯(lián)機系統(tǒng)還是采用批處理系統(tǒng)都可能產(chǎn)生一定的錯誤，由此使得計算機會計信息系統(tǒng)輸入方面的補償控制更加必要。
　　程序被非法調用篡改
　　計算機完全依靠程序進行操作。離開了程序，性能再好的計算機也像沒有拐杖的盲人一樣。對程序的控制這一在手工系統(tǒng)中不曾有的控制手段在計算機系統(tǒng)中卻至關重要。如果對任何人接近計算機系統(tǒng)缺乏控制，則未經(jīng)授權的人員也可以上機操作，改動程序。同時對于經(jīng)批準接近系統(tǒng)的操作人員加以限制也非常重要。在歷史上，無論國外還是國內，操作人員利用工作之便篡改程序達到非法目的的事件一直屢見不鮮。
　　現(xiàn)狀與要求不相適應
　　目前，存在的一個普遍現(xiàn)象是計算機專業(yè)人員往往不懂會計與審計知識，而用戶又對計算機知識知之甚少。系統(tǒng)的開發(fā)過程只能由用戶提出具體要求，由計算機專業(yè)人員進行相應設計。由于用戶和審計人員知識背景的差異，往往造成理解上的障礙，使得設計出來的計算機系統(tǒng)不能滿足用戶的需要。
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